Introdução

A pandemia do novo coronavirus tomou o mundo de assalto. Notícias em todo o lugar dão conta do rápido alastramento do vírus em todo o mundo, e os seus números são alarmantes.

Para permitir que mais e mais pessoas possam ajudar no combate ao vírus, das mais diversas formas, organizações ao redor do mundo tem disponibilizado dados sobre a evolução da COVID-19 em todo o globo.

Dentre as organizações que disponibilizam dados estão a European Union Open Data Portal, a John Hopkins University através de um repositório no GitHub.

Com abundância de dados, me propus a realizar algumas explorações e tabulações destes dados visando entender melhor o cenário mundial.

Disclaimer

Este é um trabalho em andamento; não tem cunho científico e nem pretende que sirva de embasamento para qualquer tomada de decisão. É uma abordagem estritamente pessoal.

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Base de dados do EU Open Data Portal

Os dados desta seção vieram do Europe Open Data Portal – https://data.europa.eu/euodp/en/

2020-03-26: Houve uma mudança na nomenclatura dos arquivos; a partir da atualização de 25 de Março de 2020 o arquivo não mais tem o sufixo no formato da data, por exemplo, “…2020-03-24.xlsx”. Assim, algumas partes do código estão sendo mudadas para refletir esta mudança. Não sei se é uma mudança permanente ou alguém esqueceu de colocar o nome correto do arquivo.

A estrutura dos dados é:

## Classes 'tbl_df', 'tbl' and 'data.frame':    6931 obs. of  10 variables:
##  $ DateRep                  : POSIXct, format: "2020-03-26" "2020-03-25" ...
##  $ Day                      : num  26 25 24 23 22 21 20 19 18 17 ...
##  $ Month                    : num  3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 ...
##  $ Year                     : num  2020 2020 2020 2020 2020 2020 2020 2020 2020 2020 ...
##  $ Cases                    : num  33 2 6 10 0 2 0 0 1 5 ...
##  $ Deaths                   : num  0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 ...
##  $ Countries and territories: chr  "Afghanistan" "Afghanistan" "Afghanistan" "Afghanistan" ...
##  $ GeoId                    : chr  "AF" "AF" "AF" "AF" ...
##  $ Country Code             : chr  "AFG" "AFG" "AFG" "AFG" ...
##  $ Pop_Data.2018            : num  37172386 37172386 37172386 37172386 37172386 ...

Total de Casos pelos dados da EU Open Data Portal: 26-03-2020

Casos no Mundo (EU Open Data Portal)
467710

Brasil vs Itália

Uma mostra dos últimos 20 dias da Itália.

DateRep Day Month Year Cases Deaths Country GeoId Country Code Pop_Data.2018 CumCases
2020-03-07 7 3 2020 778 49 Italy IT ITA 60431283 4636
2020-03-08 8 3 2020 1247 36 Italy IT ITA 60431283 5883
2020-03-09 9 3 2020 1492 133 Italy IT ITA 60431283 7375
2020-03-10 10 3 2020 1797 98 Italy IT ITA 60431283 9172
2020-03-11 11 3 2020 977 167 Italy IT ITA 60431283 10149
2020-03-12 12 3 2020 2313 196 Italy IT ITA 60431283 12462
2020-03-13 13 3 2020 2651 189 Italy IT ITA 60431283 15113
2020-03-14 14 3 2020 2547 252 Italy IT ITA 60431283 17660
2020-03-15 15 3 2020 90 173 Italy IT ITA 60431283 17750
2020-03-16 16 3 2020 6230 370 Italy IT ITA 60431283 23980
2020-03-17 17 3 2020 4000 347 Italy IT ITA 60431283 27980
2020-03-18 18 3 2020 3526 347 Italy IT ITA 60431283 31506
2020-03-19 19 3 2020 4207 473 Italy IT ITA 60431283 35713
2020-03-20 20 3 2020 5322 429 Italy IT ITA 60431283 41035
2020-03-21 21 3 2020 5986 625 Italy IT ITA 60431283 47021
2020-03-22 22 3 2020 6557 795 Italy IT ITA 60431283 53578
2020-03-23 23 3 2020 5560 649 Italy IT ITA 60431283 59138
2020-03-24 24 3 2020 4789 601 Italy IT ITA 60431283 63927
2020-03-25 25 3 2020 5249 743 Italy IT ITA 60431283 69176
2020-03-26 26 3 2020 5210 685 Italy IT ITA 60431283 74386

O mesmo para o Brasil, últimos 20 dias.

DateRep Day Month Year Cases Deaths Country GeoId Country Code Pop_Data.2018 CumCases
2020-03-06 6 3 2020 5 0 Brazil BR BRA 209469333 8
2020-03-07 7 3 2020 5 0 Brazil BR BRA 209469333 13
2020-03-08 8 3 2020 0 0 Brazil BR BRA 209469333 13
2020-03-09 9 3 2020 12 0 Brazil BR BRA 209469333 25
2020-03-11 11 3 2020 9 0 Brazil BR BRA 209469333 34
2020-03-12 12 3 2020 18 0 Brazil BR BRA 209469333 52
2020-03-13 13 3 2020 25 0 Brazil BR BRA 209469333 77
2020-03-14 14 3 2020 21 0 Brazil BR BRA 209469333 98
2020-03-15 15 3 2020 23 0 Brazil BR BRA 209469333 121
2020-03-16 16 3 2020 79 0 Brazil BR BRA 209469333 200
2020-03-17 17 3 2020 34 0 Brazil BR BRA 209469333 234
2020-03-18 18 3 2020 57 1 Brazil BR BRA 209469333 291
2020-03-19 19 3 2020 137 3 Brazil BR BRA 209469333 428
2020-03-20 20 3 2020 193 2 Brazil BR BRA 209469333 621
2020-03-21 21 3 2020 283 5 Brazil BR BRA 209469333 904
2020-03-22 22 3 2020 224 7 Brazil BR BRA 209469333 1128
2020-03-23 23 3 2020 418 7 Brazil BR BRA 209469333 1546
2020-03-24 24 3 2020 345 9 Brazil BR BRA 209469333 1891
2020-03-25 25 3 2020 310 12 Brazil BR BRA 209469333 2201
2020-03-26 26 3 2020 232 11 Brazil BR BRA 209469333 2433

As bases de dados não contém informação do Continente, ou seja, a qual continente pertence cada país. Assim, foi feito um merge com uma base que contém os nomes dos países, continente e a capital de cada país.

Os nomes dos países foram normalizados entre as bases, acertando grafia e outras inconsistências nos nomes. Países cujo continente não pode ser identificado foi marcado.

Alguns gráficos exploratórios com a base EU Open Data Portal

Países com mais de 500 casos confirmados: 26-03-2020

Países (com mais de 500 casos) ordenados por número de casos confirmados
País Casos Mortes
China 81968 3293
Italy 74386 7505
USA 69211 1050
Spain 47610 3434
Germany 36508 198
Iran 27017 2077
France 25233 1331
Switzerland 9714 103
United Kingdom 9529 422
South Korea 9241 131
Netherlands 6412 356
Austria 5888 34
Belgium 4937 178
Canada 3385 35
Portugal 2995 43
Norway 2916 12
Sweden 2510 42
Brazil 2433 57
Turkey 2433 59
Australia 2423 8
Israel 2369 5
Malaysia 1796 19
Denmark 1724 34
Czech Republic 1654 6
Ireland 1564 9
Luxembourg 1333 8
Japan 1268 45
Ecuador 1211 29
Chile 1142 3
Pakistan 1057 8
Poland 1051 14
Thailand 1045 4
Romania 906 13
Saudi Arabia 900 2
Finland 880 3
Greece 821 22
Indonesia 790 58
Iceland 737 2
South Africa 709 0
Russia 658 0
India 649 13
Philippines 636 38
Singapore 568 2
Peru 558 8
Qatar 537 0
Slovenia 528 4
Argentina 502 8

Base de dados da John Hopkins University

O JHU tem um site de monitoramento em tempo real (talvez o mais atualizado) no endereço https://coronavirus.jhu.edu/map.html. Os dados utilizados para o mapa estão em um GitHub https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19. Tem dados com atualização diária (parece que no mapa as atualizações são mais constantes; no final do dia são atualizados no GitHub).

Este é o link onde aparece o mapa também: https://data.humdata.org/dataset/novel-coronavirus-2019-ncov-cases

Fazendo o download dos arquivos diários ao invés destes consolidados (não tem o Recovered na última atualização)

O JHU mantém pelo menos 2 formatos dos dados: diários e consolidados (time series). Eu tentei utilizar o formato time series inicialmente, mas mudei para o formato diário, de modo que eu mesmo faço a consolidação. Isso permitiu um pouco mais de controle sobre os dados baixados.

Os dados são mantidos neste repositório GitHub:

https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19/raw/master/csse_covid_19_data/csse_covid_19_daily_reports/

O nome dos arquivos é MM-DD-YYYY.csv, começando a partir de 22 de Janeiro de 2020.

Depois de feito o download de todos os arquivos, é preciso juntá-los em um único data.frame. O processo começa com a leitura de todos os csv, colocando-os todos em uma list.

Com a lista de todos os arquivos (data.frames) diários, a função bind_rows do dplyr faz a concatenação. Algumas correções de nomes de países são também realizadas, visando normalizar e acertar grafias.

Total de Casos pelos dados da John Hopkins University (JHU): 26-03-2020

Casos Confirmados Mortos Recuperados
524902 23868 117486

Últimos 10 dias para alguns países: 26-03-2020

França
Country DateRep ConfirmedCases Deaths Recovered Continent
France 2020-03-17 7683 148 12 Europe
France 2020-03-18 9052 148 12 Europe
France 2020-03-19 10886 243 12 Europe
France 2020-03-20 12632 450 12 Europe
France 2020-03-21 14308 562 12 Europe
France 2020-03-22 16214 676 2201 Europe
France 2020-03-23 20123 862 2207 Europe
France 2020-03-24 22622 1102 3288 Europe
France 2020-03-25 25600 1333 3907 Europe
France 2020-03-26 29551 1698 4955 Europe
Itália
Country DateRep ConfirmedCases Deaths Recovered Continent
Italy 2020-03-17 31506 2503 2941 Europe
Italy 2020-03-18 35713 2978 4025 Europe
Italy 2020-03-19 41035 3405 4440 Europe
Italy 2020-03-20 47021 4032 4440 Europe
Italy 2020-03-21 53578 4825 6072 Europe
Italy 2020-03-22 59138 5476 7024 Europe
Italy 2020-03-23 63927 6077 7432 Europe
Italy 2020-03-24 69176 6820 8326 Europe
Italy 2020-03-25 74386 7503 9362 Europe
Italy 2020-03-26 80589 8215 10361 Europe
Espanha
Country DateRep ConfirmedCases Deaths Recovered Continent
Spain 2020-03-17 11748 533 1028 Europe
Spain 2020-03-18 13910 623 1081 Europe
Spain 2020-03-19 17963 830 1107 Europe
Spain 2020-03-20 20410 1043 1588 Europe
Spain 2020-03-21 25374 1375 2125 Europe
Spain 2020-03-22 28603 1756 2125 Europe
Spain 2020-03-23 35136 2311 3355 Europe
Spain 2020-03-24 39885 2808 3794 Europe
Spain 2020-03-25 49515 3647 5367 Europe
Spain 2020-03-26 57786 4365 7015 Europe
Brasil
Country DateRep ConfirmedCases Deaths Recovered Continent
Brazil 2020-03-17 321 1 2 America
Brazil 2020-03-18 372 3 2 America
Brazil 2020-03-19 621 6 2 America
Brazil 2020-03-20 793 11 2 America
Brazil 2020-03-21 1021 15 2 America
Brazil 2020-03-22 1546 25 2 America
Brazil 2020-03-23 1924 34 2 America
Brazil 2020-03-24 2247 46 2 America
Brazil 2020-03-25 2554 59 2 America
Brazil 2020-03-26 2985 77 6 America

Para poder estudar o crescimento do número de casos e de mortes, foi adicionada uma coluna com o número de casos de um dia para o outro, já que a base de dados reporta o total de casos em cada dia e não quantos casos foram registrados naquele dia.

Lista de países ordenados por número de casos confirmados: 26-03-2020

País Casos Mortes Recuperados
USA 83836 1209 681
China 81782 3291 74181
Italy 80589 8215 10361
Spain 57786 4365 7015
Germany 43938 267 5673
France 29551 1698 4955
Iran 29406 2234 10457
United Kingdom 11812 580 150
Switzerland 11811 191 131
South Korea 7478 53 118
Netherlands 7468 435 6
Austria 6909 49 112
Belgium 6235 220 675
Canada 4042 38 184
Turkey 3629 75 26
Portugal 3544 60 43
Norway 3369 14 6
Brazil 2985 77 6
Sweden 2840 77 16
Australia 2810 13 172
Israel 2693 8 68
Malaysia 2031 23 215
Denmark 2023 41 50
Ireland 1819 19 5
Luxembourg 1453 9 6
Ecuador 1403 34 3
Japan 1387 47 359
Chile 1306 4 22
Poland 1221 16 7
Pakistan 1201 9 21
Thailand 1045 4 88
Romania 1029 23 94
Saudi Arabia 1012 3 33
Finland 958 5 10
South Africa 927 0 12
Indonesia 893 78 35
Greece 892 26 36
Russia 840 3 38
Iceland 802 2 82
India 727 20 45
Philippines 707 45 28
Singapore 683 2 172
Peru 580 9 14
Slovenia 562 6 10
Panama 558 8 2
Qatar 549 0 43
Estonia 538 1 8
Argentina 502 9 63
Croatia 495 3 22
Egypt 495 24 102
Colombia 491 6 8
Dominican Republic 488 10 3
Mexico 475 6 4
Bahrain 458 4 204
Serbia 384 1 0
Iraq 382 36 105
Lebanon 368 6 23
Algeria 367 25 29
United Arab Emirates 333 2 52
Lithuania 299 4 1
Armenia 290 1 18
New Zealand 283 0 27
Morocco 275 11 8
Bulgaria 264 3 8
Hungary 261 10 28
Latvia 244 0 1
Costa Rica 231 2 2
Slovakia 226 0 2
Andorra 224 3 1
Uruguay 217 0 0
Jordan 212 0 1
Kuwait 208 0 49
San Marino 208 21 4
North Macedonia 201 3 3
Tunisia 197 6 2
Ukraine 196 5 1
Bosnia-Herzegovina 191 3 2
Moldova 177 1 2
Albania 174 6 17
Vietnam 153 0 20
Burkina Faso 152 7 10
Cyprus 146 3 4
Malta 134 0 2
Ghana 132 4 1
Azerbaijan 122 3 15
Brunei 114 0 5
Kazakhstan 111 1 2
Oman 109 0 23
Venezuela 107 0 15
Sri Lanka 106 0 7
Senegal 105 0 9
Cambodia 96 0 10
Ivory Coast 96 0 3
Afghanistan 94 4 2
Belarus 86 0 29
Mauritius 81 2 0
Georgia 79 0 11
Cameroon 75 1 2
Uzbekistan 75 0 0
Kosovo 71 1 0
Montenegro 69 1 0
Cuba 67 2 1
Nigeria 65 1 2
Trinidad and Tobago 65 1 0
Liechtenstein 56 0 0
Honduras 52 1 0
Rwanda 50 0 0
Taiwan 45 1 15
Bangladesh 44 5 11
Kyrgyzstan 44 0 0
Bolivia 43 0 0
Czech Republic 41 0 0
Paraguay 41 3 0
Monaco 33 0 1
Kenya 31 1 1
Jamaica 26 1 2
Guatemala 25 1 4
Madagascar 23 0 0
Togo 23 0 1
Palestine 22 0 0
Barbados 18 0 0
Zambia 16 0 0
Uganda 14 0 0
El Salvador 13 0 0
Maldives 13 0 8
Tanzania 13 0 0
Equatorial Guinea 12 0 0
Ethiopia 12 0 0
Djibouti 11 0 0
Dominica 11 0 0
Mongolia 11 0 0
Niger 10 1 0
Bahamas 9 0 1
Haiti 8 0 0
Namibia 8 0 2
Suriname 8 0 0
Antigua and Barbuda 7 0 0
Gabon 7 1 0
Grenada 7 0 0
Mozambique 7 0 0
Seychelles 7 0 0
Benin 6 0 0
Eritrea 6 0 0
Laos 6 0 0
Fiji 5 0 0
Guyana 5 1 0
Syria 5 0 0
Angola 4 0 0
Cape Verde 4 1 0
Guinea 4 0 0
Holy See 4 0 0
Mali 4 0 0
Central African Republic 3 0 0
Chad 3 0 0
Gambia 3 1 0
Liberia 3 0 0
Mauritania 3 0 0
Nepal 3 0 1
Saint Lucia 3 0 0
Sudan 3 1 0
Zimbabwe 3 1 0
Belize 2 0 0
Bhutan 2 0 0
Guinea-Bissau 2 0 0
Nicaragua 2 0 0
Saint Kitts and Nevis 2 0 0
Somalia 2 0 0
East Timor 1 0 0
Libya 1 0 0
Papua New Guinea 1 0 0
Saint Vincent and the Grenadines 1 0 0
Republic of the Congo 0 0 0

Alguns gráficos exploratórios com a base do JHU

Evolução dos casos após o 30º caso confirmado
DateRep Japan USA Italy France Germany Spain Brazil Argentina Chile
2020-02-06 45
2020-02-15 43
2020-02-16 59
2020-02-17 66
2020-02-18 74
2020-02-19 84
2020-02-20 94
2020-02-21 105 35
2020-02-22 122 35 62
2020-02-23 147 35 155
2020-02-24 159 53 229
2020-02-25 170 53 322
2020-02-26 189 59 453
2020-02-27 214 60 655 38 46
2020-02-28 228 62 888 57 48 32
2020-02-29 241 70 1128 100 79 45
2020-03-01 256 76 1694 130 130 84
2020-03-02 274 101 2036 191 159 120
2020-03-03 293 122 2502 204 196 165
2020-03-04 331 153 3089 285 262 222
2020-03-05 360 221 3858 377 482 259
2020-03-06 420 278 4636 653 670 400
2020-03-07 461 417 5883 949 799 500
2020-03-08 502 537 7375 1126 1040 673
2020-03-09 511 605 9172 1209 1176 1073
2020-03-10 581 959 10149 1784 1457 1695 31
2020-03-11 639 1281 12462 2284 1908 2277 38
2020-03-12 639 1663 12462 2284 2078 2277 52
2020-03-13 701 2179 17660 3667 3675 5232 151 31 43
2020-03-14 773 2726 21157 4480 4585 6391 151 34 61
2020-03-15 839 3499 24747 4513 5795 7798 162 45 74
2020-03-16 825 4632 27980 6650 7272 9942 200 56 155
2020-03-17 878 6421 31506 7683 9257 11748 321 68 201
2020-03-18 889 7786 35713 9052 12327 13910 372 79 238
2020-03-19 924 13680 41035 10886 15320 17963 621 97 238
2020-03-20 963 19101 47021 12632 19848 20410 793 128 434
2020-03-21 1007 25493 53578 14308 22213 25374 1021 158 537
2020-03-22 1086 33746 59138 16214 24873 28603 1546 266 632
2020-03-23 1128 43667 63927 20123 29056 35136 1924 266 746
2020-03-24 1193 53740 69176 22622 32986 39885 2247 387 922
2020-03-25 1307 65778 74386 25600 37323 49515 2554 387 1142
2020-03-26 1387 83836 80589 29551 43938 57786 2985 502 1306

Calculando a taxa de progressão dia-a-dia: Brasil, Itália, USA, França, Alemanha, Espanha

DateRep Brazil France Germany Italy Japan China Spain USA
2020-03-01 1.00 1.30 1.65 1.50 1.062 1.01 1.87 1.09
2020-03-02 1.00 1.47 1.22 1.20 1.070 1.00 1.43 1.33
2020-03-03 1.00 1.07 1.23 1.23 1.069 1.00 1.38 1.21
2020-03-04 2.00 1.40 1.34 1.23 1.130 1.00 1.35 1.25
2020-03-05 1.00 1.32 1.84 1.25 1.088 1.00 1.17 1.44
2020-03-06 3.25 1.73 1.39 1.20 1.167 1.00 1.54 1.26
2020-03-07 1.00 1.45 1.19 1.27 1.098 1.00 1.25 1.50
2020-03-08 1.54 1.19 1.30 1.25 1.089 1.00 1.35 1.29
2020-03-09 1.25 1.07 1.13 1.24 1.018 1.00 1.59 1.13
2020-03-10 1.24 1.48 1.24 1.11 1.137 1.00 1.58 1.59
2020-03-11 1.23 1.28 1.31 1.23 1.100 c(“1.00”, “1.00”) 1.34 1.34
2020-03-12 1.37 1.00 1.09 1.00 1.000 c(“1.00”, “1.00”) 1.00 1.30
2020-03-13 2.90 1.61 1.77 1.42 1.097 1.00 2.30 1.31
2020-03-14 1.00 1.22 1.25 1.20 1.103 1.00 1.22 1.25
2020-03-15 1.07 1.01 1.26 1.17 1.085 1.00 1.22 1.28
2020-03-16 1.23 1.47 1.25 1.13 0.983 1.00 1.27 1.32
2020-03-17 1.60 1.16 1.27 1.13 1.064 1.00 1.18 1.39
2020-03-18 1.16 1.18 1.33 1.13 1.013 1.00 1.18 1.21
2020-03-19 1.67 1.20 1.24 1.15 1.039 1.00 1.29 1.76
2020-03-20 1.28 1.16 1.30 1.15 1.042 1.00 1.14 1.40
2020-03-21 1.29 1.13 1.12 1.14 1.046 1.00 1.24 1.33
2020-03-22 1.51 1.13 1.12 1.10 1.078 1.00 1.13 1.32
2020-03-23 1.24 1.24 1.17 1.08 1.039 1.00 1.23 1.29
2020-03-24 1.17 1.12 1.14 1.08 1.058 1.00 1.14 1.23
2020-03-25 1.14 1.13 1.13 1.08 1.096 1.00 1.24 1.22
2020-03-26 1.17 1.15 1.18 1.08 1.061 1.00 1.17 1.27

Países com números de casos semelhantes ao Brasil: 26-03-2020

Olhando os dados de: - Portugal - Suécia (Sweden) - Turquia (Turkey) - Israel - Austrália (Australia)

Evolução dos casos após o 30º caso confirmado
DateRep Australia Sweden Israel Portugal Brazil Turkey
2020-03-02 30
2020-03-03 39
2020-03-04 52 35
2020-03-05 55 94
2020-03-06 60 101
2020-03-07 63 161
2020-03-08 76 203 39 30
2020-03-09 91 248 39 30
2020-03-10 107 355 58 41 31
2020-03-11 128 500 109 59 38
2020-03-12 128 599 131 59 52
2020-03-13 200 814 161 112 151
2020-03-14 250 961 193 169 151
2020-03-15 297 1022 251 245 162
2020-03-16 377 1103 255 331 200
2020-03-17 452 1190 337 448 321 47
2020-03-18 568 1279 433 448 372 98
2020-03-19 681 1439 677 785 621 192
2020-03-20 791 1639 705 1020 793 359
2020-03-21 1071 1763 883 1280 1021 670
2020-03-22 1490 1931 1071 1600 1546 1236
2020-03-23 1682 2046 1442 2060 1924 1529
2020-03-24 2044 2286 1930 2362 2247 1872
2020-03-25 2364 2526 2369 2995 2554 2433
2020-03-26 2810 2840 2693 3544 2985 3629

Calculando a taxa de progressão dia-a-dia: Brazil, Portugal, Sweden, Turkey, Israel, Australia

DateRep Australia Brazil Israel Sweden Portugal Turkey
2020-03-01 1.08 1.00 1.43 1.17
2020-03-02 1.11 1.00 1.00 1.07 NA
2020-03-03 1.30 1.00 1.20 1.40 1.00
2020-03-04 1.33 2.00 1.25 1.67 2.50
2020-03-05 1.06 1.00 1.07 2.69 1.60
2020-03-06 1.09 3.25 1.31 1.07 1.62
2020-03-07 1.05 1.00 1.00 1.59 1.54
2020-03-08 1.21 1.54 1.86 1.26 1.50
2020-03-09 1.20 1.25 1.00 1.22 1.00
2020-03-10 1.18 1.24 1.49 1.43 1.37
2020-03-11 1.20 1.23 1.88 1.41 1.44 NA
2020-03-12 1.00 1.37 1.20 1.20 1.00 1.00
2020-03-13 1.56 2.90 1.23 1.36 1.90 5.00
2020-03-14 1.25 1.00 1.20 1.18 1.51 1.00
2020-03-15 1.19 1.07 1.30 1.06 1.45 1.20
2020-03-16 1.27 1.23 1.02 1.08 1.35 3.00
2020-03-17 1.20 1.60 1.32 1.08 1.35 2.61
2020-03-18 1.26 1.16 1.28 1.07 1.00 2.09
2020-03-19 1.20 1.67 1.56 1.13 1.75 1.96
2020-03-20 1.16 1.28 1.04 1.14 1.30 1.87
2020-03-21 1.35 1.29 1.25 1.08 1.25 1.87
2020-03-22 1.39 1.51 1.21 1.10 1.25 1.84
2020-03-23 1.13 1.24 1.35 1.06 1.29 1.24
2020-03-24 1.22 1.17 1.34 1.12 1.15 1.22
2020-03-25 1.16 1.14 1.23 1.10 1.27 1.30
2020-03-26 1.19 1.17 1.14 1.12 1.18 1.49

Base de dados do Worldometer

Esta base de dados tem uma atualização bem interessante, com algumas variáveis também interessantes.

Ela está disponível em https://www.worldometers.info/coronavirus/

O problema é que não achei nenhum csv ou xlsx para baixar; então vou tentar fazer um web scraping e pegar os dados. Utilizando o pacote rvest e seguindo a dica deste post foi razoavelmente fácil.

Olhando a estrutura destes dados:

## 'data.frame':    201 obs. of  10 variables:
##  $ Country,Other    : chr  "China" "USA" "Italy" "Spain" ...
##  $ TotalCases       : chr  "81,340" "85,762" "80,589" "64,059" ...
##  $ NewCases         : chr  "+55" "+327" "" "+6,273" ...
##  $ TotalDeaths      : chr  "3,292" "1,306" "8,215" "4,858" ...
##  $ NewDeaths        : int  5 11 NA 493 18 144 NA 15 NA 8 ...
##  $ TotalRecovered   : chr  "74,588" "1,868" "10,361" "9,357" ...
##  $ ActiveCases      : chr  "3,460" "82,588" "62,013" "49,844" ...
##  $ Serious,Critical : chr  "1,034" "2,122" "3,612" "4,165" ...
##  $ Tot Cases/1M pop : chr  "57" "259" "1,333" "1,370" ...
##  $ Tot Deaths/1M pop: num  2 4 136 104 3 28 26 24 9 3 ...

Depois de pegar a tabela em html e colocar em um data.frame, algumas limpezas e transformações são necessárias: algumas colunas, como a NewCases, tem o símbolo +; os números vieram formatados como strings com separador de milhar (,), e algumas outras coisas. Então, algumas manipulações serão feitas para acertar isso.

Country,Other TotalCases NewCases TotalDeaths NewDeaths TotalRecovered ActiveCases Serious,Critical Tot Cases/1M pop Tot Deaths/1M pop
China 81,340 +55 3,292 5 74,588 3,460 1,034 57 2
USA 85,762 +327 1,306 11 1,868 82,588 2,122 259 4
Italy 80,589 8,215 10,361 62,013 3,612 1,333 136
Spain 64,059 +6,273 4,858 493 9,357 49,844 4,165 1,370 104
Germany 47,373 +3,435 285 18 5,673 41,415 23 565 3
Iran 32,332 +2,926 2,378 144 11,133 18,821 2,893 385 28

Total de Casos pelos dados do Worldometer: 27-03-2020

TotalCasos TotalMortes TotalRecuperados
552943 25045 128706

Lista de países ordenados por número de casos confirmados: 27-03-2020

Country TotalCases TotalDeaths TotalRecovered
USA 85762 1306 1868
China 81340 3292 74588
Italy 80589 8215 10361
Spain 64059 4858 9357
Germany 47373 285 5673
Iran 32332 2378 11133
France 29155 1696 4948
Switzerland 12311 207 897
UK 11658 578 135
S. Korea 9332 139 4528
Netherlands 8603 546 3
Austria 7393 58 225
Belgium 7284 289 858
Portugal 4268 76 43
Canada 4043 39 228
Norway 3687 16 6
Turkey 3629 75 26
Australia 3180 13 170
Sweden 3046 92 16
Israel 3035 11 79
Brazil 2991 77 6
Malaysia 2161 26 259
Czechia 2062 9 11
Denmark 2010 52 1
Ireland 1819 19 5
Chile 1610 5 22
Luxembourg 1453 9 6
Ecuador 1403 34 3
Japan 1387 47 359
Romania 1292 24 115
Poland 1289 16 7
Pakistan 1252 9 23
Thailand 1136 5 97
Saudi Arabia 1104 3 35
Indonesia 1046 87 46
Finland 1041 5 10
Russia 1036 3 45
South Africa 927 2 12
Greece 892 27 42
Iceland 890 2 82
India 863 20 73
Philippines 803 54 31
Diamond Princess 712 10 597
Singapore 683 2 172
Panama 674 9 2
Slovenia 632 9 10
Argentina 589 13 72
Mexico 585 8 4
Peru 580 9 14
Estonia 575 1 11
Croatia 551 3 37
Qatar 549 43
Hong Kong 518 4 111
Egypt 495 24 102
Colombia 491 6 8
Dominican Republic 488 10 3
Bahrain 466 4 227
Iraq 458 40 122
Serbia 457 8 15
Lebanon 391 7 23
New Zealand 368 37
Algeria 367 25 29
Lithuania 345 5 1
UAE 333 2 52
Armenia 329 1 28
Hungary 300 10 34
Latvia 280 1
Bulgaria 276 3 9
Morocco 275 11 8
Slovakia 269 2
Andorra 267 3 1
Taiwan 267 2 30
Uruguay 238
Costa Rica 231 2 2
Bosnia and Herzegovina 230 3 5
Tunisia 227 6 2
Ukraine 226 5 5
Kuwait 225 57
North Macedonia 219 3 3
Jordan 212 2
San Marino 208 21 4
Albania 186 8 31
Moldova 177 2 2
Vietnam 163 20
Burkina Faso 152 7 10
Cyprus 146 3 4
Faeroe Islands 144 54
Malta 139 2
Ghana 136 4 1
Kazakhstan 135 1 3
Réunion 135 1
Oman 131 23
Azerbaijan 122 3 15
Senegal 119 11
Brunei 115 11
Venezuela 107 1 31
Sri Lanka 106 7
Cambodia 99 11
Ivory Coast 96 3
Afghanistan 94 4 2
Belarus 94 32
Palestine 91 1 17
Cameroon 88 2 2
Uzbekistan 83 1 5
Mauritius 81 2
Martinique 81 1
Georgia 81 13
Channel Islands 80 1
Guadeloupe 73 1
Montenegro 70 1
Honduras 68 1
Cuba 67 2 1
Nigeria 65 1 3
Trinidad and Tobago 65 1
Bolivia 61
Kyrgyzstan 58
Liechtenstein 56
Paraguay 52 3 1
DRC 51 3 2
Mayotte 50
Rwanda 50
Bangladesh 48 5 11
Gibraltar 35 13
Macao 34 10
Monaco 33 1
Kenya 31 1 1
French Polynesia 30
Isle of Man 29
Aruba 28 1
French Guiana 28 6
Jamaica 26 1 2
Guatemala 25 1 4
Togo 25 1
Barbados 24
Madagascar 24
Uganda 18
Ethiopia 16
Zambia 16
Bermuda 15 2
New Caledonia 15
Maldives 14 9
El Salvador 13
Tanzania 13 1
Djibouti 12
Equatorial Guinea 12
Dominica 11
Mali 11
Mongolia 11
Saint Martin 11
Niger 10 1
Bahamas 9 1
Greenland 9 2
Cayman Islands 8 1
Guinea 8
Haiti 8
Namibia 8 2
Suriname 8
Curaçao 7 1 2
Gabon 7 1
Antigua and Barbuda 7
Grenada 7
Mozambique 7
Seychelles 7
Benin 6
Eritrea 6
Laos 6
Eswatini 6
Cabo Verde 5 1
Guyana 5 1
Zimbabwe 5 1
Fiji 5
Montserrat 5
Myanmar 5
Syria 5
Nepal 4 1
Angola 4
Congo 4
Vatican City 4
Gambia 3 1
Sudan 3 1
Bhutan 3
CAR 3
Chad 3
Liberia 3
Mauritania 3
St. Barth 3
Saint Lucia 3 1
Sint Maarten 3
Somalia 3
Nicaragua 2 1
Anguilla 2
Belize 2
British Virgin Islands 2
Guinea-Bissau 2
Saint Kitts and Nevis 2
Turks and Caicos 2
Libya 1
Papua New Guinea 1
St. Vincent Grenadines 1
Timor-Leste 1

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